1、抵扣不同：增值税专用发*可以抵扣进项税，普通发*不可以抵扣进项税。这是他们最主要的区别，后面联次、内容的区别都是基于此产生的；

2、联次不同。专用发*有四联，包括开票方用于留存备查的存根联、用于购买方记账的发*联，用于购买方扣税凭证的抵扣联，用于销售方记账的记账联。普通发*不能抵扣，所以没有抵扣联，只有其他的三联；

3、使用主体不同。专用发*一般使用主体为增值税一般纳税人，一般情况下，不包括小规模纳税人，小规模纳税人只能经税务机关批准后由当地税务机关代开；普通发*是未办理税务登记的纳税人也可直接向税务机关申请领购使用；

4、发*的内容不同。专用发*除了包括普通发*所具备的内容外，还包括增值税方面的内容。